NSUN3 (NOP2/Sun RNA Methyltransferase Family Member 3) är en gen som kodar för en RNA-metyltransferas involverad i modifiering av mitokondriella tRNA. Denna modifiering är viktig för korrekt proteinsyntes och funktion i mitokondrierna. Mutationer i NSUN3 har kopplats till mitokondriella sjukdomar.