Pseudomonas i avföring avser närvaron av bakterier från släktet Pseudomonas, vanligast Pseudomonas aeruginosa, i mag-tarmkanalen. Även om det vanligtvis inte är en vanlig invånare i tarmen, kan det orsaka infektion eller överväxt, särskilt hos individer med försvagat immunförsvar. Dess upptäckt kan indikera en obalans i tarmfloran eller en underliggande sjukdom, särskilt om gastrointestinala symtom föreligger.
Förhöjda nivåer av Pseudomonas-arter kan förekomma vid inflammation i tarmen. Förhöjda nivåer kan leda till diarré och lös avföring.
Testning för Pseudomonas i avföringen är fördelaktigt för personer med ihållande gastrointestinala problem, särskilt om immunförsvaret är nedsatt eller efter en sjukhusvistelse nyligen. Detta gäller patienter med kroniska tarmsjukdomar, personer som nyligen har genomgått antibiotikabehandling och personer som tidigare har haft infektioner på sjukhus.