Mage/tarm

Acinetobacter spp. är en grupp gramnegativa bakterier som vanligtvis finns i jord, vatten och ibland i den mänskliga tarmen. Även om de inte är dominerande i en frisk mikrobiom kan vissa stammar kolonisera tarmarna, särskilt efter antibiotikaanvändning eller i sjukhusmiljöer. Vissa arter, såsom Acinetobacter baumannii, är kända för sin antibiotikaresistens och deras roll vid infektioner, särskilt hos immunsupprimerade personer. Vid faecesanalys kan förekomsten av Acinetobacter spegla miljöexponering, mikrobiell obalans eller antibiotikarelaterade förändringar i tarmfloran.

Akkermansia muciniphila är en tarmbakterie som stödjer upprätthållandet av tarmens slemhinna och en hälsosam tarmvägg. Den är kopplad till fördelaktiga metabola och immunologiska effekter och kan spela en viktig roll för tarmhälsa, viktreglering och allmänt välbefinnande.

Alpha-1 antitrypsin (AAT) är ett protein som huvudsakligen produceras av levern och som hjälper till att skydda lungorna och andra organ från enzymer som orsakar inflammation. Att mäta AAT-nivåer i avföring kan hjälpa till att upptäcka tarmproteinförlust och inflammation, vilket underlättar diagnosen av gastrointestinala tillstånd såsom inflammatorisk tarmsjukdom och proteinförlustenteropati.

Ammoniak är en kvävehaltig förening som produceras i tarmen genom nedbrytning av proteiner och aminosyror av tarmbakterier. I en frisk tarm används det mesta av ammoniaken antingen av mikrober eller absorberas och avgiftas av levern. Förhöjda nivåer av ammoniak i feces kan tyda på överdriven proteinjäsning, tarmdysbios eller en obalans mellan gynnsamma och skadliga bakterier. Höga nivåer kan bidra till slemhinneirritation, inflammation och kan äventyra tarmens barriärfunktion. Ammoniaknivåer är en användbar markör för mikrobial proteinmetabolism och tarmhälsa.

Beta-glukuronidas är ett enzym som produceras av vissa tarmbakterier och som kan bryta bindningen mellan glukuronsyra och olika toxiner, hormoner eller läkemedel som har förberetts för eliminering av levern. Förhöjd beta-glukuronidasaktivitet i avföringen kan tyda på mikrobiell obalans och kan störa avgiftningen genom att reaktivera ämnen som östrogen och xenobiotika i kolon. Denna reaktivering kan bidra till systemisk toxicitet eller hormonella obalanser. Mätning av beta-glukuronidas i avföring hjälper till att bedöma mikrobiell metabolism och avgiftningsförmåga i tarmen.

Bilophila wadsworthii är en gramnegativ, anaerob, svavelreducerande bakterie som vanligtvis finns i små mängder i den mänskliga tarmen. Den kan metabolisera gallsyror och reducera svavelföreningar till vätesulfid (H₂S), en gas som i överdrivna mängder kan vara giftig för tarmens epitelceller och försämra tarmens integritet. Förhöjda nivåer av Bilophila wadsworthii har kopplats till inflammatoriska tillstånd såsom kolit och kan indikera en dysbiotisk tarmmiljö, särskilt som svar på kost med högt fett- eller högt animaliskt protein-innehåll. Denna bakterie anses vara en potentiell patobiont på grund av dess förmåga att främja inflammation under vissa förhållanden.

Butyrivibrio spp. är gynnsamma tarmbakterier kända för att producera butyrat, en kortkedjad fettsyra som spelar en nyckelroll för att upprätthålla tarmhälsa. Butyrat stödjer integriteten i tarmens slemhinna, minskar inflammation och fungerar som en primär energikälla för kolonens celler. Närvaro av Butyrivibrio anses generellt vara en positiv indikator på en hälsosam mikrobiom. Låga nivåer kan tyda på minskad produktion av butyrat, vilket kan kopplas till tarminflammation eller dysbios. Dessa bakterier trivs på kostfiber och tillhör fylumet Firmicutes.

Candida dubliniensis är en jästart som är nära besläktad med Candida albicans och kan vara en del av den normala mikrobiella floran i mag-tarmkanalen. Under vissa förhållanden, såsom nedsatt immunförsvar, dysbios eller högt sockerintag, kan den överväxa och bidra till svampobalans samt mag-tarmsymtom. Den är mindre vanlig än C. albicans men har många liknande egenskaper, inklusive dess förmåga att bilda biofilmer och orsaka slemhinneinfektioner. Att mäta dess nivåer i avföring hjälper till att bedöma svampöverväxt och balansen i tarmens mykobiom.

Candida glabrata är en jästart som naturligt kan finnas i människans mag-tarmkanal och urinvägar. Även om den vanligtvis är ofarlig hos friska individer, kan den bli opportunistisk hos personer med nedsatt immunförsvar och potentiellt leda till infektioner. Jämfört med andra Candida-arter tenderar C. glabrata att vara mer resistent mot vanliga antifungala behandlingar. Dess överväxt i avföringsprover kan tyda på mikrobiell obalans (dysbios), immunosuppression eller tidigare antibiotikaanvändning. Övervakning av dess nivåer kan ge insikter om den övergripande tarmhälsan och känsligheten för svampöverväxt.

Candida krusei är en jästart som kan vara en del av tarmens mykobrott, men den förekommer vanligtvis i låga antal. Den är känd för sin naturliga resistens mot vissa svampdödande behandlingar, särskilt flukonazol, vilket gör dess identifiering kliniskt relevant. En överväxt av C. krusei kan uppstå hos individer med komprometterad tarmflora, nedsatt immunförsvar eller högt sockerintag. Förhöjda nivåer i avföringen kan spegla en rubbning i mikrobiell balans eller ett jästöverväxttillstånd som kan bidra till matsmältningsbesvär och systemiska symtom.

Candida lusitaniae är en mindre vanlig jästart som kan vara en del av den normala floran i människokroppen men har kopplats till opportunistiska infektioner, särskilt hos individer med försvagat immunsystem. Den är särskilt känd för sin potentiella resistens mot vissa svampbehandlingar, särskilt amphotericin B. Vid avföringsanalys kan förekomsten av C. lusitaniae indikera svampöverväxt eller dysbios, särskilt när den finns i förhöjda mängder. Dess upptäckt är viktig för att bedöma tarmens mikrobiella balans och vägleda vidare klinisk utredning vid behov.

Candida parapsilosis är en jästart som kan ingå i den normala människans mikrobiota, särskilt på huden och i mag-tarmkanalen. Även om den ofta är ofarlig hos friska individer kan den bli opportunistisk och orsaka infektioner, särskilt hos inlagda eller immunsupprimerade patienter. Den är vanligtvis kopplad till kateterrelaterade infektioner, sårinfektioner och ibland mag-tarmstörningar. Förhöjda nivåer i avföringen kan indikera en obalans i tarmens mikrobiom, nyligen antibiotikaanvändning eller nedsatt immunfunktion. Övervakning av dess närvaro kan vara relevant för att bedöma svampöverväxt eller tarmdysbios.

Candida spp är en grupp jästliknande svampar som kan påverka olika delar av kroppen, inklusive tarmen och vaginan. Dessa svampar orsakar ofta symtom såsom klåda, obehag och flytningar, vilket vanligtvis beror på en obalans i kroppens naturliga flora. I tarmen kan Candida spp störa matsmältningen, vilket leder till uppblåsthet och förändringar i tarmvanor. Faktorer som kost, allmän hälsa och användning av antibiotika kan bidra till deras överväxt, och det är viktigt att åtgärda dessa faktorer för att återställa balansen och lindra symtomen.

Candida tropicalis är en jästsvamp som kan förekomma som en del av den normala mänskliga mikrofloran, särskilt i mag-tarmkanalen och på slemhinnor. Den har en högre patogen potential jämfört med vissa andra icke-albicans Candida-arter och är ofta förknippad med systemiska infektioner hos immunsupprimerade individer. I tarmen kan förhöjda nivåer av C. tropicalis tyda på svampöverväxt, dysbios eller ett nedsatt immunförsvar. Dess närvaro i avföringstester kan hjälpa till att identifiera obalanser i tarmens mykobiom och potentiella källor till inflammation eller infektion.

Citrobacter spp. är en grupp gramnegativa bakterier som tillhör familjen Enterobacteriaceae. De förekommer vanligtvis i jord, vatten och tarmkanalen hos människor och djur. Medan vissa arter utgör en del av den normala tarmfloran i små mängder, kan förhöjda nivåer indikera dysbios eller en överväxt. Vissa arter, som Citrobacter freundii, har kopplats till mag-tarmstörningar, urinvägsinfektioner och sjukhusförvärvade infektioner hos sårbara individer. Vid avföringsprov kan förekomsten av Citrobacter tyda på mikrobiell obalans, immunstress eller tidigare antibiotikaanvändning.

Coprococcus spp. är fördelaktiga bakterier i den mänskliga tarmmikrobiomen och tillhör stammen Firmicutes. Dessa mikrober är kända för sin förmåga att producera smörsyra, en kortkedjad fettsyra som stödjer tarmbarriärens integritet, reglerar inflammation och främjar övergripande matsmältningshälsa. Högre nivåer av Coprococcus förknippas ofta med en välbalanserad mikrobiom och förbättrat psykiskt välbefinnande, eftersom smörsyra också kan påverka hjärnhälsan via tarm-hjärnaxeln. Låga nivåer kan spegla dålig fiberjäsning, tarmdysbios eller inflammation. Deras närvaro anses generellt vara en markör för en hälsosam, fiberrik kost.

D-arabinitol är en sockeralkohol som används som en biomarkör i kroppen för att hjälpa till att upptäcka Candida-infektioner. Förhöjda nivåer av D-arabinitol indikerar ofta en överväxt av Candida, särskilt hos immunnedsatta individer. Mätning av D-arabinitol ger ett snabbare och mindre invasivt sätt att diagnostisera systemisk kandidiasis jämfört med traditionella odlingsmetoder.

Desulfomonas pigra är en art av sulfat-reducerande bakterier (SRB) som finns i anaeroba miljöer, inklusive människans tarm. Den spelar en roll i svavelmetabolismen genom att reducera sulfat till vätesulfid (H₂S). Även om vätesulfid är en naturligt förekommande förening i kolon, kan förhöjda nivåer som produceras av SRB som D. pigra störa tarmbarriärens funktion och bidra till gastrointestinal inflammation eller obehag. Ökad förekomst av Desulfomonas pigra kan indikera en överväxt av svavelreducerande mikrober, vilket potentiellt är kopplat till kost med högt innehåll av svavelförenade livsmedel eller obalanser i tarmens mikrobiota.

Desulfovibrio piger är en vanlig sulfatresulterande bakterie (SRB) i den mänskliga tarmmikrobiotan. Den reducerar sulfat och andra svavelhaltiga föreningar till vätesulfid (H₂S), en gas som i små mängder spelar fysiologiska roller men i överskott kan vara toxisk för tarmceller. Förhöjda nivåer av D. piger har kopplats till mag-tarmsjukdomar såsom inflammatorisk tarmsjukdom (IBD) och irritabel tarm-syndrom (IBS). Dess förekomst kan spegla ett ökat svavelintag genom kosten eller en rubbad mikrobell balans som gynnar svavelmetabolism.

Diamin oxidase (DAO) är ett enzym som hjälper till att bryta ner histamin, en förening som är involverad i immunfunktion, matsmältning och nervsystemets aktivitet. Hälsosamma nivåer av DAO är viktiga för att reglera histaminbalansen och minska risken för histaminintolerans.

Dysbiosisindexet är ett mått som används för att bedöma graden av obalans i tarmmikrobiomet och indikerar förekomsten och svårighetsgraden av dysbios. Det kvantifierar avvikelser i mikrobiell mångfald och sammansättning jämfört med en frisk referenspopulation. Ett högre index tyder på större dysbios, vilket kan vara kopplat till hälsoproblem som inflammation, matsmältningsstörningar eller metabola tillstånd.

Pankreaselastas är ett enzym som produceras av bukspottkörteln och spelar en viktig roll vid proteinspjälkning. Att mäta dess nivåer i avföringen kan ge viktiga insikter om bukspottkörtelns funktion. Eftersom enzymet förblir stabilt i fekalier, fungerar det som en pålitlig markör för att bedöma den exokrina funktionen i bukspottkörteln, särskilt vid diagnos av pankreasinsufficiens.

Enterotyper är klassificeringar av den mänskliga tarmmikrobiomen baserade på de dominerande bakteriegrupperna och deras metabola funktioner. Det finns tre huvudtyper av enterotyper: Bacteroides-dominerande (Typ 1), Prevotella-dominerande (Typ 2) och Ruminococcus-dominerande (Typ 3). Varje typ har unika egenskaper i hur näringsämnen som fetter, kolhydrater och proteiner metaboliseras. Till exempel är Prevotella (Typ 2) mer effektivt på kolhydratutnyttjande, särskilt vid fiberrika dieter, men mindre kapabelt att syntetisera vissa vitaminer. Din enterotyp kan påverka näringsupptaget, tarmhälsan och hur din kropp reagerar på olika typer av diet.

Equol är en förening som produceras av tarmbakterier under metabolismen av sojaisoflavonet daidzein. Det fungerar som ett icke-steroidalt östrogen och kan ha olika hälsofördelar, inklusive antioxidativa och hormonbalanserande effekter. Endast vissa individer har dock de specifika tarmbakterierna som kan producera equol. Att mäta equol i avföring hjälper till att avgöra om tarmens mikrobiom kan omvandla daidzein effektivt, vilket ger insikt i den mikrobiella mångfalden och funktionen kopplad till östrogenmetabolism.

Eubacterium spp. är en mångsidig grupp anaeroba bakterier som finns i människans tarm, klassificerade inom fylumet Firmicutes. Många arter inom detta släkte spelar en gynnsam roll för att upprätthålla tarmhälsan genom att producera kortkedjiga fettsyror (SCFAs), särskilt butyrat. Dessa föreningar bidrar till att näringstäta kolonens celler, stödja immunfunktionen och minska inflammation. Vissa arter kan också vara involverade i metabolismen av gallsyror och syntesen av vitaminer. En obalans i Eubacterium-populationer kan vara kopplad till dysbios eller kroniska gastrointestinala tillstånd.

Faecalibacterium prausnitzii (F. prausnitzii) är en nyckelbakterie i den mänskliga tarmen, känd för sina antiinflammatoriska effekter. Den spelar en viktig roll för att upprätthålla tarmhälsan genom att stödja en balanserad mikrobiom och stärka tarmbarriären.

Fekalt occult blod (FOB) är ett mått som upptäcker dolt blod i avföringen, vilket inte är synligt för blotta ögat. Förekomsten av FOB kan vara en viktig indikator på inre gastrointestinal blödning, som ofta sker utan tydliga symtom. FOB-testning är en icke-invasiv metod som används för att hjälpa till att identifiera potentiella underliggande medicinska tillstånd som påverkar matsmältningskanalen.

Fenoler är organiska föreningar som kan produceras av tarmbakterier under fermenteringen av vissa aminosyror, särskilt tyrosin. Vissa fenoler, såsom p-kresol, kan ha toxiska effekter vid höga koncentrationer och är förknippade med dysbios eller obalanser i tarmmikrobiotan. Förhöjda fenolnivåer i avföring kan spegla mikrobiell aktivitet som kan belasta leverns avgiftningssystem. Övervakning av fenoler hjälper till att bedöma hur väl tarmen hanterar proteinbrytning och mikrobiella fermenteringsprocesser.

Firmicutes är en av de största bakteriephyla i den mänskliga tarmens mikrobiom och omfattar många arter som är involverade i energiutvinning från mat. Dessa bakterier är effektiva på att bryta ner komplexa kolhydrater och producera kortkedjiga fettsyror, vilket kan stödja tarm- och ämnesomsättningshälsa. En oproportionerligt hög andel Firmicutes i förhållande till Bacteroidetes har i vissa studier kopplats till fetma och metabola störningar. Balansen av Firmicutes är därför en viktig markör för att bedöma mikrobiell mångfald och potentiella metabola tendenser. Individuella hälsoeffekter beror på den övergripande sammansättningen och värdfaktorer.

Fusobacterium är ett släkte av anaeroba, gramnegativa bakterier som naturligt finns i människans munhåla, mag-tarmkanal och ibland i vaginalfloran. Medan vissa arter kan ingå som en del av den normala mikrobiomen är Fusobacterium också känt för sin koppling till inflammation och infektion. Höga nivåer i tarmen har kopplats till tillstånd som inflammatorisk tarmsjukdom (IBD) och kolorektal cancer. Dess närvaro anses ofta vara en markör för mikrobiell obalans eller patogen överväxt, särskilt när den förekommer tillsammans med symtom som uppblåsthet eller förändrade tarmvanor.

Gallsyror är föreningar som är avgörande för nedbrytning av fetter, producerade i levern och lagrade i gallblåsan. Medan de flesta återabsorberas i kroppen, utsöndras en del med avföringen. Mätning av gallsyror i avföring hjälper till att bedöma matsmältningshälsa, särskilt vid diagnos av fettmalabsorption och relaterade tillstånd.

Geotrichum candidum är en svamp som vanligtvis finns i miljön, inklusive jord, vatten, luft och vissa livsmedel. Den är också en naturlig del av den mänskliga mikrobiotan och finns vanligtvis i tarmen och på huden. Även om den oftast är ofarlig kan den bli opportunistisk och orsaka infektioner hos personer med försvagat immunförsvar.

Histamin (avföring) är en diagnostisk markör som används för att bedöma allergisk och inflammatorisk aktivitet i mag-tarmkanalen. Histamin är en biogen amin som frisätts av immunceller som svar på allergener och spelar en nyckelroll vid inflammation. Förhöjda nivåer av histamin i avföringen kan indikera tillstånd som matallergier, inflammatorisk tarmsjukdom (IBD) eller mastcellsaktivering, vilket hjälper till att styra diagnos och behandling av relaterade immunsvar.

Histaminproducerande bakterier är tarmmikrober som kan omvandla aminosyran histidin till histamin, en biogen amin som spelar en central roll i immunreaktioner och allergiska reaktioner. Även om histamin är en nödvändig signalsubstans kan överproduktion i tarmen bidra till symtom som liknar allergier, såsom utslag, huvudvärk eller matsmältningsbesvär. Dessa bakterier kan frodas vid kronisk stress, nedsatt tarmbarriärfunktion eller kost rik på histidinhaltiga livsmedel. Förhöjda nivåer är kopplade till tillstånd som histaminintolerans eller pseudoallergier. Att upprätthålla en balanserad mikrobiom och korrekt tarmbarriärintegritet kan bidra till att minska histaminbelastningen från mikrobiella källor.

Indoxylsulfat är ett uremiskt toxin som bildas när tarmbakterier metaboliserar aminosyran tryptofan till indol, som sedan upptas och omvandlas till indoxylsulfat i levern. Medan små mängder normalt utsöndras via njurarna kan förhöjda nivåer indikera nedsatt avgiftning, dysbios eller njurstress. Indoxylsulfat har kopplats till oxidativ stress, systemisk inflammation och vaskulär dysfunktion—särskilt hos personer med nedsatt njurfunktion. Det fungerar som en markör för både mikrobiell aktivitet och kroppens förmåga att bearbeta och eliminera metaboliskt avfall.

Jäst är en typ av svamp som naturligt finns i människokroppen, särskilt i tarmen och på huden. I normala mängder är den ofarlig och en del av den hälsosamma mikrobiomen. Däremot kan en obalans leda till överväxt, vilket kan orsaka olika hälsoproblem. Faktorer såsom kost, antibiotikaanvändning och allmän hälsa kan påverka jästnivåerna.

Kalprotektin är ett protein som finns i vita blodkroppar och fungerar som en markör för inflammation, särskilt i tarmen. Genom att mäta kalprotektinnivåerna i avföringen kan man bedöma graden av tarminflammation. Detta test är användbart för att diagnostisera och följa inflammatoriska tarmsjukdomar (IBD) såsom Crohns sjukdom och ulcerös kolit, samt för att särskilja dem från irritabel tarm-syndrom (IBS), som vanligtvis inte ger förhöjda kalprotektinnivåer.

Avföringsfettestet är ett diagnostiskt mått som kvantifierar mängden fett som utsöndras i avföringsprover. Det används för att bedöma fettupptag och för att upptäcka malabsorptionssyndrom. Förhöjda fettnivåer i avföringen, känt som steatorré, kan tyda på problem med matsmältning eller upptag i mag-tarmkanalen. Testet hjälper till att diagnostisera tillstånd som pankreasinsufficiens, cystisk fibros, celiaki och Crohns sjukdom.

Den kvantitativa bestämningen av kväve (N) är ett laboratorietest som mäter kvävenivåer i kroppens utsöndringar, vanligtvis urin eller avföring, för att bedöma proteinets matsmältning och absorption. Detta test är avgörande för att utvärdera näringsstatus, särskilt i kliniska miljöer där protein-energi undernäring eller obalanser kan vara en fråga. Det ger viktiga insikter i metabola funktioner relaterade till proteinomsättning och kan hjälpa till att diagnostisera tillstånd som påverkar proteinmetabolismen, inklusive njursjukdom, malabsorptionssyndrom och vissa metabola störningar.

Det kvantitativa avföringssockertestet är ett diagnostiskt verktyg som mäter mängden specifika sockerarter i avföringen för att bedöma kolhydratmalabsorption. Det hjälper till att identifiera tillstånd som laktosintolerans, fruktosintolerans och andra störningar som påverkar nedbrytning och upptag av sockerarter. Genom att upptäcka onedbrutna sockerarter såsom laktos, fruktos eller sorbitol i avföringen, hjälper detta test vårdgivare att fastställa vilka sockerarter matsmältningssystemet har svårt att bearbeta, vilket ofta är kopplat till symtom som uppblåsthet, gasbildning, diarré och buksmärta.

Analys av vatteninnehåll i avföring är ett test som mäter mängden vatten som finns i feces. Denna bedömning är viktig för att diagnostisera tillstånd relaterade till onormal vattenabsorption eller sekretion i mag-tarmkanalen. Den hjälper till att identifiera orsaker till diarré, vilka kan bero på infektioner, inflammatoriska tarmsjukdomar (IBD), irritabel tarmsyndrom (IBS) eller malabsorptionssyndrom, där det antingen förekommer överdriven vattensekretion eller otillräcklig absorption i tarmarna.

Mångfald avser variationen av bakteriearter som finns i tarmens mikrobiom. En högre mikrobiel mångfald är i allmänhet förknippad med bättre matsmältningshälsa, immunsystemets funktion och motståndskraft mot patogener. Låg mångfald kan å andra sidan kopplas till inflammation, dåligt näringsupptag och olika kroniska hälsotillstånd.

Metanandningstest är en diagnostisk metod som mäter mängden metangas som produceras av tarmbakterier. Metan bildas av specifika tarmmikrober under jäsningen av vissa kolhydrater. Förhöjda metannivåer vid andningstester är kopplade till tillstånd såsom Small Intestinal Bacterial Overgrowth (SIBO), fruktosintolerans och sorbitolintolerans, vilka kan orsaka symtom som uppblåsthet, förstoppning, magont och förändrade tarmvanor.

Methanobrevibacter-arter är arkéer — mikroorganismer som skiljer sig från bakterier — och som främst lever i den mänskliga tarmen. Dessa mikrober är kända för att producera metangas som en biprodukt vid jäsning, särskilt från väte och koldioxid. Förhöjda nivåer av Methanobrevibacter spp. har kopplats till fördröjd tarmpassage och symtom som förstoppning och uppblåsthet. Till skillnad från många bakterier påverkas inte arkéer av vanliga antibiotika, vilket gör deras överväxt svårare att hantera. Deras närvaro ger insikt i balansen mellan mikrobiella samhällen och gasproduktion i tarmen.

Morganella spp., mest anmärkningsvärt Morganella morganii, är gramnegativa bakterier som tillhör familjen Enterobacteriaceae. De betraktas som opportunistiska patogener och återfinns ibland i människans tarmkanal som en del av den normala floran. Förhöjda nivåer i avföring kan dock indikera dysbios eller potentiell infektionsrisk, särskilt hos immunnedsatta individer. Morganella är också känd för sin produktion av biogena aminer, såsom putrescin och kadaverin, vilka kan bidra till symtom i tarmen och systemiska symtom. Inom kliniska miljöer har Morganella morganii kopplats till urinvägsinfektioner och andra sjukhusförvärvade infektioner.

Stolens pH-värde är ett mått som indikerar surhetsgraden eller alkaliniteten i tarmarna. Det speglar balansen i metaboliska processer såsom jäsning och proteinnedbrytning. Ett lågt pH-värde i avföringen tyder ofta på ökad jäsning av komplexa sockerarter av tarmbakterier, vilket kan försura avföringen. Omvänt kan ett högt pH-värde i avföringen bero på överdriven proteinmetabolism, vilket leder till produktion av ammoniak och andra föreningar som höjer pH-nivån i avföringen.

Proteobacteria är en stor fylum av gramnegativa bakterier som inkluderar både harmlösa kommensaler och potentiella patogener. I tarmen kan en liten mängd Proteobacteria vara normalt, men förhöjda nivåer betraktas ofta som en markör för dysbios och inflammation. Denna grupp inkluderar arter såsom Escherichia, Salmonella, Helicobacter och Klebsiella, varav några är kopplade till mag-tarmstörningar, infektioner och metabola obalanser. En ökad förekomst av Proteobacteria kan återspegla mikrobiell instabilitet eller en proinflammatorisk tarmmiljö.

Providencia spp. är gramnegativa, fakultativt anaeroba bakterier som tillhör familjen Enterobacteriaceae. De är vanligtvis inte dominerande medlemmar i tarmfloran, men kan förekomma i små mängder. Vissa arter, såsom Providencia stuartii och Providencia rettgeri, betraktas som opportunistiska patogener och har kopplats till urinvägsinfektioner och mag-tarmstörningar. Förhöjda nivåer i ett avföringsprov kan tyda på mikrobiell obalans (dysbios) eller en överrepresentation av potentiellt patogena stammar. Providencia-arter är också kända för sin förmåga att producera urease och bidra till ammoniakbildning.

Roseburia spp. är fördelaktiga, anaeroba bakterier som tillhör phylum Firmicutes och är vanliga invånare i en frisk människas tarm. Dessa bakterier är kända för sin förmåga att producera butyrat, en kortkedjig fettsyra som fungerar som en viktig energikälla för kolonceller och hjälper till att minska inflammation i tarmen. En välbalanserad nivå av Roseburia är ofta förknippad med bättre metabol hälsa, förbättrad barriärfunktion i tarmen och lägre risk för inflammatoriska sjukdomar. Minskade nivåer har kopplats till tillstånd såsom fetma, typ 2-diabetes och inflammatorisk tarmsjukdom.

Ruminococcus spp. är en grupp anaeroba bakterier inom phylum Firmicutes, som vanligtvis finns i den mänskliga tarmens mikrobiota. De spelar en betydande roll i fermenteringen av komplexa kolhydrater och produktionen av kortkedjiga fettsyror som acetat och butyrat, vilka stödjer tarmhälsa och energimetabolism. Ruminococcus-arter anses viktiga för att upprätthålla en balanserad tarmmiljö, särskilt på grund av deras förmåga att bryta ner fiber. Förändrade nivåer av Ruminococcus har kopplats till matsmältningsbesvär, irritabel tarm-syndrom (IBS) och metabola störningar.

Nivån av sekretorisk IgA (sIgA) speglar mängden av ett viktigt immunglobulin kallat Immunoglobulin A, som huvudsakligen finns i slemhinneområden såsom tarmarna, luftvägarna och saliven. Sekretorisk IgA spelar en avgörande roll i kroppens första försvarslinje genom att binda till patogener och förhindra deras inträde, vilket hjälper till att skydda slemhinnorna och stödja den övergripande immun- och tarmhälsan.

Sekundära gallsyror bildas i tjocktarmen genom bakteriell omvandling av primära gallsyror som ursprungligen syntetiseras i levern. Även om de har roller i matsmältning och mikrobiell reglering kan förhöjda nivåer signalera dysbios, överdrivet fettintag eller förändrad gallsyreomsättning. Vissa sekundära gallsyror, såsom deoxicholsyra (DCA) och litokholsyra (LCA), har kopplats till slemhinneirritation, inflammation och ökad risk för kolorektala sjukdomar vid beständigt förhöjda nivåer. Att mäta dem i avföring hjälper till att bedöma tarmens mikrobiella aktivitet och gallsyredetoxifieringens status.

Trimetylamin (TMA) är en metabolit som produceras av tarmbakterier under nedbrytningen av kolin, karnitin och lecitin—näringsämnen som ofta finns i kött, ägg och mejeriprodukter. I levern omvandlas TMA till trimetylamin N-oxid (TMAO), en förening som i flera studier kopplats till kardiovaskulär risk. Förhöjda nivåer av TMA/TMAO kan återspegla hög mikrobiell omvandlingsaktivitet i tarmen, en obalans i mikrofloran eller en kost rik på animaliska produkter. Även om forskningen pågår har höga TMAO-nivåer associerats med inflammation och försämrad kolesterolmetabolism. En balanserad tarmflora och växtbaserade kostmönster kan hjälpa till att upprätthålla hälsosamma TMAO-nivåer.

Vätgasandningstest är ett diagnostiskt verktyg som mäter mängden väte i utandningsluften, vilket produceras av bakteriell jäsning i tarmarna. Detta test används ofta för att identifiera tillstånd som Small Intestinal Bacterial Overgrowth (SIBO), fruktosintolerans och sorbitolintolerans. Förhöjda vätehalter tyder på att ojämnt nedbrutna kolhydrater jäser av tarmbakterier, vilket kan orsaka symtom som uppblåsthet, diarré och buksmärta.

Zonulin är ett protein som reglerar permeabiliteten i täta fogar mellan celler i matsmältningskanalen. Det spelar en nyckelroll i att upprätthålla tarmbarriären genom att kontrollera passage av ämnen, såsom näringsämnen och antigener, från tarmen in i blodomloppet. Obalanser i zonulinnivåer kan påverka tarmens genomsläpplighet och potentiellt bidra till olika hälsoproblem.